Можно ли изменить наименование и ОКВЭД в процессе покупки АО?

Да, конечно. Смена наименования и изменение ОКВЭД оформляются одной формой вместе со сменой Генерального директора, поэтому занимают те же 5 рабочих дней. Дополнительных расходов нет.